Бразилец является воспитанником «Атлетико Паранаэнсе». За основную команду полузащитник дебютировал в 2013 году.
В завершившемся чемпионате Бразилии Эрнани провёл 24 встречи, в которых отметился четырьмя забитыми мячами, сообщает официальный сайт «Зенита».
По информации СМИ, за переход Эрнани российский клуб заплатил около €8 млн.