Его обвиняют в трёх эпизодах превышения полномочий при капитальном ремонте трёх школ и спортивной площадки в Геническе Херсонской области в 2024 году в период нахождения на посту руководителя Главного управления строительства Краснодарского края.
По версии гособвинения, Нестеренко подписывал акты приёмки выполненных работ на объектах с заведомо ложными сведениями, а в расходных документах стоимость была фиктивно завышена.
«Вину не признаю, мною не был причинён материальный ущерб», — цитирует Нестеренко РИА Новости.
По его словам, в подписанных им актах была указана лишь часть выполненных работ, от 46% до 69% от сметы контрактов, а также не было сведений о стоимости работ, которые фактически не выполнены, и не включено фиктивное удорожание стоимости работ.
О задержании экс-замгубернатора Кубани Нестеренко стало известно в конце мая 2025 года.
Позднее Октябрьский районный суд Краснодара арестовал его по обвинению в злоупотреблении должностными полномочиями, повлёкшем тяжкие последствия.